Кафедра биологии, биоресурсов и аквакультуры получила своё название в 2009 г. До этого она называлась кафедрой зоологии и рыбоводства (с 1970 г.). В разное время она именовалась кафедрой зоологии, кафедрой зоологии и дарвинизма, кафедрой зоологии и защиты растений. После организации факультета защиты растений преподавание части дисциплин перешло на этот факультет.

Как кафедра она существует с 1936 года – с момента организации Новосибирского сельскохозяйственного института. Организатором и первым руководителем кафедры была профессор Виноградова Таисия Васильевна. С 1937 по 1939 г. кафедрой руководил доцент Янушевич Алексей Иванович. Митлюченко Кузьма Захарович возглавлял кафедру с 1940 по 1949 г. и одновременно работал деканом зоотехнического факультета. Доцент Кривощеков Георгий Михайлович работал заведующим кафедрой с 1950 по 1976 г., он положил начало ихтиологическим, гидробиологическим и рыбоводным исследованиям. В 1964-1965 гг. он также был деканом факультета. Многие годы с 1976 по 2001 г. кафедру возглавлял профессор Кашковский Владимир Георгиевич, известный учёный в области пчеловодства. С 2001 г. кафедрой руководит профессор, доктор биологических наук Морузи Ирина Владимировна – одна из авторов новой породы рыб – алтайский зеркальный карп.

На кафедре ведётся большая работа по подготовке бакалавров и магистров по направлениям подготовки биология и зоотехния. Проводится значительная научная и внедренческая работа в области рыбоводства по совершенствованию алтайского зеркального карпа и по изучению кормовой базы Западной Сибири и Северного Казахстана для пчеловодства.

В разное время на кафедре работали доцентами: З.А. Мошегова, Н.Д. Машинская, Э.Г. Скрипченко, Н.Н. Моисеев, Н.А. Прусевич, Н.В. Добряков; старшими преподавателями: Л.С. Тихонов и М.Э. Гранцон; ассистентами: Б.Д. Сурнова и А.Н. Казанцев; старшими лаборантами: Б.С. Семёнов, А.Г. Ценер, А.Е. Каликина, М.В. Макарова, А.А. Заматаева, Л. Булдакова, Н. Воробьёва, Н.К. Колотовкина, А.А. Плахова, Н.Н. Бицко, В.В. Усова, М.М. Планкина, К.В. Францева, Н.С. Сазонова, М.В. Шмакова, А.М. Корнякова.

В настоящее время кафедра работает в следующем составе: заведующая кафедрой – профессор, д.б.н. И.В. Морузи; профессора, доктора наук: В.Г. Кашковский, Л.А. Осинцева, Е.В. Пищенко; доценты, кандидаты наук:  А.А. Плахова, П.В. Белоусов, С.В. Севастеев, Д.В. Кропачев; заведующая лабораторией – А.М. Корнякова.

К обучению студентов привлекаются сотрудники Института систематики и экологии животных СО РАН (доктор биологических наук Ю.Н. Литвинов), ФГУП «Госрыбцентр» (доктор с.-х. наук А.А. Ростовцев, доктор биологических наук Л.В. Веснина) и др.

На базе кафедры биологии, биоресурсов и аквакультуры создан диссертационный совет ДМ 220.048.06 по защите докторских и кандидатских диссертаций по специальностям 03.02.10 – гидробиология (биологические науки) и 06.04.01 – рыбное хозяйство и аквакультура (биологические науки). Председателем совета является профессор И.В. Морузи, учёным секретарём - доцент Д.В. Кропачев.